La Sede Regional de Guanacaste se organiza para su funcionamiento académico en departamentos y secciones.
Los departamentos son divisiones académicas especializadas que agrupan profesores y cursos de determinadas disciplinas iguales o afines para desarrollar docencia, investigación y acción social. En todas las situaciones, los departamentos agrupan carreras propias de la Sede Regional, descentralizadas o desconcentradas de una facultad (no dividida en escuelas), de una escuela, según lo acordado por el Consejo Universitario.
Dirección de Departamentos
Departamento de Artes Filosofía y Letras
Departamento de Ciencia y Tecnología
Departamento de Ciencias Sociales
•Se puede reservar para actividades previamente coordinadas, debe incluir cantidad de personas un máximo de 4 personas, no se permite bebidas ni alimentos de ningún tipo. Reserva previa al correo electrónico 
• Pizarra acrílica. • Aire acondicionado. • Pupitres.